《秘密研究所综合福利》是一部以喜剧为中心,讲述三个性格不同的人因为金钱而产生矛盾,最终因为爱和理解而和解的故事。
影片一开始,三个主角分别是一个屌丝男、一个富二代和一个拜金女。屌丝男名叫张三,是一个典型的穷屌丝,口袋里经常连一百块都没有。富二代名叫李四,家境优渥,是一个典型的纨绔子弟。拜金女名叫王五,是一个典型的拜金女,只喜欢有钱人。
张三、李四和王五原本是三个毫不相干的人,但因为一次意外,他们三个卷入了一场金钱纠纷。张三因为欠了李四的钱,不得不躲起来。李四为了追讨债务,找上了张三的女朋友王五。王五见李四有钱,便抛弃了张三,与李四在一起。张三知道后,非常伤心,便决定报复李四和王五。
张三找了一个机会,把李四和王五骗到一个荒山野岭,然后把他们绑了起来。张三告诉李四和王五,他要让李四和王五知道钱不是万能的,并对李四和王五实施了各种精神和肉体的折磨。李四和王五被折磨得痛不欲生,最终向张三求饶。张三见李四和王五真心悔过,便放了他们。
李四和王五被放了之后,痛定思痛,决定重新做人。李四用自己的钱帮助张三还清了债务,并向张三的女朋友王五道歉。王五也意识到自己以前的行为是错误的,便向张三和李四道歉。三个人冰释前嫌,最终和解。